Долгие годы они "мотались" из Сакраменто в Такому и обратно, а позднее и в Сан-Франциско, Солт-Лейк-Сити, Лос-Анджелес и, наконец, Сан-Диего. Среди названий команд во время "путешествий" было Сан-Франциско Мишенс.
Назвавшись таким образом, команда отдала дань уважения Францисканской миссии, которая сыграла важную роль в истории штата Калифорния.
Вновь, переехав в Сан-Диего, команда пересмотрела свои взгляды в сторону названия "Падрес".
Эта команда Тихоокеанской лиги была "сердцем" бейсбола в Сан-Диего с 1936 по 1968 год, когда владелец Арнхолт Смит выиграл тендер на свободное место в Национальной лиге, которую планировалось расширить в 1969-м году. Смит расформировал команду Тихоокеанской лиги (PCL), а название Сан-Диего Падрес присвоил новому клубу, выступавшему уже в Главной лиге.